Торжественное открытие факультета Генерального штаба Вооруженных Сил, созданного в соответствии с Указом Президента Республики Беларусь от 22 марта 2006 г. № 178, состоялось накануне 1 сентября 2006 г. на базе Военной академии Республики Беларусь. В церемонии открытия факультета Генерального штаба Вооруженных Сил приняли участие Министр обороны генерал-полковник Мальцев Л.С.), заместитель Государственного секретаря Совета безопасности Шалев М.Н., руководители силовых ведомств.
Первым начальником факультета Генерального штаба Вооруженных Сил учреждения образования "Военная академия Республики Беларусь" был назначен кандидат военных наук генерал-майор запаса Портнов Ю.В.
Открытие факультета является знаменательной вехой в истории Вооруженных Сил Республики Беларусь, ибо с появлением данного факультета завершилось создание полного цикла подготовки военных кадров в национальной системе военного образования. Отныне генералы и офицеры белорусской армии имеют возможность пройти отечественную высшую школу совершенствования своего военно-профессионального мастерства.
Факультет Генерального штаба Вооруженных Сил призван обеспечить подготовку профессиональной военной элиты, способной командовать соединениями, объединениями и видами Вооруженных Сил, руководить управлениями центрального аппарата Министерства обороны и Генерального штаба в современных условиях.
На основании Устава учреждения образования "Военная академия Республики Беларусь" приказом начальника Генерального штаба Вооруженных Сил первого заместителя Министра обороны Республики Беларусь от 28 апреля 2006 г. № 200 утверждено
Положение о факультете Генерального штаба Вооруженных Сил, определившее предназначение и основные задачи факультета, функции его структурных подразделений, порядок организации учебной, методической, научной и идеологической работы.
В 2008 году состоялся первый выпуск генералов и офицеров, завершивших обучение на факультете Генерального штаба это знаменательное событие в жизни Вооруженных Сил Республики Беларусь и свидетельство практического завершения реализации полного цикла подготовки военных кадров в национальной системе военного образования.
Уже сегодня накопленный на факультете опыт в системе подготовки военных кадров вызывает интерес во многих странах. В частности, помимо белорусских военнослужащих с 2008 года к занятиям на факультете Генерального штаба Вооруженных Сил Военной академии Республики Беларусь приступили представители вооруженных сил других государств.
С 01 августа 2017 года факультет Генерального штаба Вооруженных Сил осуществляет подготовку офицеров оперативно-стратегического и оперативно-тактического уровней.
Срок обучения военнослужащих Республики Беларусь и иностранных военнослужащих составляет 2 года в очной форме и 3 года в заочной.
На факультете преподают только генералы и офицеры, имеющие богатый опыт службы на командных и штабных должностях.
Каждый четвертый преподаватель защитил диссертацию по военным наукам.
Более 50 выпускников факультета стали генералами и возглавляют министерства и ведомства, командуют войсками и объединениями, руководят департаментами и управлениями. Более 40 выпускникам присвоены ученые степени и звания и они сегодня возглавляют и трудятся в научных организациях и учреждениях образования.